マフラーと共にカスタムしたいのが、エアークリナー。

抜けの良いカスタムのマフラーには、吸気効率のより良い（ハイフローと呼ばれる）エアクリーナーを使用することで、更なるパワーアップが期待できる。 吸気のみパフォーマンスの良いものにしても排気効率が伴わないことには、せっかくのパフォーマンスを引き出すことが出来ない。吸気と排気のバランスが大切である。ハイフローのエアクリーナーに変えてインジェクションをしっかりと行うと確実にパワーアップする。

ダイナモデル用のエアクリーナーは各社から様々なデザインのものがリリースされている。 バックプレート（エアクリーナーを固定しているプレート）ごと交換できるので、デザインも多様。ハーレーカスタムの醍醐味でもある。